Întrucât etiopatogenia BC nu este pe deplin elucidată, se consideră că scopul principal al tratamentului îl constituie controlul bolii, cu următoarele obiective: • Ameliorarea simptomelor şi inducerea remisiunii; • Menţinerea unei stări de nutriţie corespunzătoare; • Diminuarea leziunilor inflamatorii intestinale; • Prevenirea recidivelor şi complicaţiilor.